菜籽油的贮藏方法基本上同大豆油相同。值得注意的是，机榨菜籽油色泽深黄而不发绿，透明度较强，土榨菜籽油色泽橙黄而发绿，透明度差。无论机榨、土榨的菜籽油，入库前都必须过滤或沉淀，将水分和杂质除去，方可长期贮藏。